| Постоянная ссылка (СИД2) |
J2163362X1X |
| Название |
Геномная характеристика mecA-положительных Staphylococcus aureus ST59, проявляющих чувствительность к оксациллину |
| Автор |
Гостев В. В. |
| Автор |
Сулян О. С. |
| Автор |
Павлова П. А. |
| Автор |
Нестерова Е. В. |
| Автор |
Калиногорская О. С. |
| Автор |
Чулкова П. С. |
| Автор |
Трофимова Н. Н. |
| Автор |
Агеевец В. А. |
| Автор |
Агеевец И. В. |
| Автор |
Сидоренко С. В. |
| Источник |
Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия |
| Страницы/Объём |
116-122 |
| Сокращ. назв. источника |
Клин. микробиол. и антимикроб. химиотерапия |
| Год |
2023 |
| Том |
25 |
| Номер |
2 |
| Адрес в Интернет |
http://elibrary.ru/item.asp?id=54503130 |
| Постоянная ссылка (СИД) |
J2163362X |
| Ключевые слова (авторские) |
геномная эпидемиология%оксациллин%цефокситин |
| Место хранения |
Удаленный доступ. Эл. регистр. НЭБ |
| Дата регистрации в ВИНИТИ |
09.10.2023 |
| Язык текста |
русский |
| Язык резюме |
английский |
| Аннотация |
Цель: провести геномную характеристику представителей mecA-положительных оксациллиночувствительных Staphylococcus aureus ST59, выделенных в Санкт-Петербурге. В работу включены девять mecA-положительных оксациллиночувствительных изолятов S. aureus (OS-MRSA), относящихся к сиквенс-типу ST59. Изоляты были выделены в Санкт-Петербурге в 2018-2019 гг. у детей без признаков стафилококковых инфекций при скрининге на носительство S. aureus. Один изолят был выделен у взрослого пациента с инфекцией кожи и мягких тканей (ИКМТ). Проведена оценка чувствительности к антибиотикам и полногеномное секвенирование. Для сравнительной геномной эпидемиологии в работу включены 242 генома S. aureus ST59 из публичных репозиториев. Изоляты характеризовались фенотипической чувствительностью к оксациллину, определенной методом серийных разведений и с помощью системы VITEK. Диапазон значений диаметров зон ингибирования вокруг дисков с цефокситином составлял 17-22 мм. Изоляты имели МПК ≤ 0,5 мкг/мл к пенициллину/клавуланату. S. aureus, выделенные от носителей, имели генотип ST59t1950-SCCmec Vb (seb+); изолят, выделенный при ИКМТ, имел генотип ST59-t437-SCCmec Vb (seb/ lukF/lukS+). Все изоляты имели мутации в промоторе mecA в положении -33 (C/T) и мутации в PBP2a (S225R + E246G). На основе филогенетического анализа и Байесовской кластеризации вся выборка геномов ST59 была разделена на четыре кластера; все российские геномы относились к Восточно-Азиатской сублинии ST59, для которой характерно наличие токсина PVL. Попарные сравнения нуклеотидных замен между геномами российских изолятов показали высокую степень идентичности: медиана 13, межквартильный интервал 8 - 18 замен. Наличие энтеротоксина B, а также мутаций в промоторных областях гена mecA (-7 G/A или -33 C/T) и мутаций в PBP2a (S225R и E246G) являлись отличительной особенностью всех кластеров ST59, при этом для российских изолятов была характерна промоторная мутация только в положении -33. Геномы российских изолятов отличались от глобально циркулирующих ST59 уникальными мутациями в следующих локусах (относительно референс-генома S. aureus M013TW): регуляторе катаболизма лактозы RS03495 (N168D); рибосомальном белке L28 (V47A); предположительной глиоксалазе RS07825 (V42A); гипотетическом белке RS13235 (K32E). Российские изоляты MRSA-ST59 относятся к Восточно-Азиатской сублинии и характеризуются наличием гена энтеротоксина В. Отличительной фенотипической особенностью MRSA-ST59 является чувствительность к оксациллину и пограничная устойчивость к цефокситину. Для OS-MRSA фенотипов существует риск неправильной оценки чувствительности и, как следствие, назначение неадекватной антибактериальной терапии. Выявление гена mecA является наиболее точным методом для дифференциации MSSA и MRSA |
| Тематический раздел |
Биология |
| Издательский номер в РЖ |
23.12-04Я2.73 |
| Шифр ГРНТИ |
34.27.21 |
| Ключевые слова |
антибиотикочувствительность, оксациллин; Staphylococcus aureus (Bact.), тип ST59, mecA-положительный, изоляты; геном, полное секвенирование, мутации; филогенетический анализ |
|